Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
VAV2P52735 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
VAV2P52735 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
VAV2P52735 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
VAV2P52735 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
VAV2P52735 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
VAV2P52735 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
VAV2P52735 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
VAV2P52735 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV2P52735 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV2P52735 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV2P52735 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
VAV2P52735 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
VAV2P52735 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms