Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLCNKBP51801 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLCNKBP51801 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms