Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRCA2P51587 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRCA2P51587 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRCA2P51587 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms