Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PSMB2P49721 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PSMB2P49721 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms