Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
AMTP48728 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMTP48728 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMTP48728 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMTP48728 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMTP48728 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMTP48728 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AMTP48728 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
AMTP48728 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
AMTP48728 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms