Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RPL21P46778 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RPL21P46778 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RPL21P46778 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL21P46778 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL21P46778 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RPL21P46778 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RPL21P46778 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RPL21P46778 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL21P46778 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RPL21P46778 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RPL21P46778 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPL21P46778 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPL21P46778 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms