Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSG1P42857 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSG1P42857 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NSG1P42857 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NSG1P42857 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
NSG1P42857 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
NSG1P42857 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NSG1P42857 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NSG1P42857 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NSG1P42857 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NSG1P42857 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NSG1P42857 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NSG1P42857 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms