Protein–RNA interactions for Protein: P42126

ECI1, Enoyl-CoA delta isomerase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECI1P42126 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECI1P42126 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECI1P42126 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ECI1P42126 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ECI1P42126 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ECI1P42126 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms