Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
APOBEC1P41238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
APOBEC1P41238 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms