Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HADHAP40939 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HADHAP40939 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HADHAP40939 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HADHAP40939 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HADHAP40939 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
HADHAP40939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHAP40939 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHAP40939 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHAP40939 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HADHAP40939 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HADHAP40939 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HADHAP40939 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HADHAP40939 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HADHAP40939 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHAP40939 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHAP40939 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHAP40939 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HADHAP40939 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms