Protein–RNA interactions for Protein: P40337

VHL, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VHLP40337 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VHLP40337 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VHLP40337 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VHLP40337 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VHLP40337 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VHLP40337 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VHLP40337 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VHLP40337 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VHLP40337 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VHLP40337 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VHLP40337 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VHLP40337 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VHLP40337 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VHLP40337 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VHLP40337 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms