Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KRT2P35908 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KRT2P35908 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KRT2P35908 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KRT2P35908 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT2P35908 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT2P35908 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KRT2P35908 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KRT2P35908 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KRT2P35908 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KRT2P35908 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms