Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GPC1P35052 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GPC1P35052 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPC1P35052 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GPC1P35052 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GPC1P35052 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GPC1P35052 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GPC1P35052 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GPC1P35052 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GPC1P35052 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms