Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PSMA1P25786 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PSMA1P25786 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms