Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LAMA1P25391 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LAMA1P25391 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LAMA1P25391 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms