Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BCKDHBP21953 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BCKDHBP21953 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms