Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDK11BP21127 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDK11BP21127 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDK11BP21127 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms