Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CAPN3P20807 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN3P20807 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN3P20807 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN3P20807 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CAPN3P20807 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CAPN3P20807 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAPN3P20807 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms