Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PDE6GP18545 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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PDE6GP18545 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PDE6GP18545 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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