Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB8P17481 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB8P17481 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms