Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CCL3L1P16619 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCL3L1P16619 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms