Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2A2P16615 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP2A2P16615 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms