Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CD46P15529 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CD46P15529 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CD46P15529 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CD46P15529 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CD46P15529 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CD46P15529 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CD46P15529 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD46P15529 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD46P15529 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD46P15529 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms