Protein–RNA interactions for Protein: P11055

MYH3, Myosin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH3P11055 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH3P11055 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MYH3P11055 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MYH3P11055 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MYH3P11055 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MYH3P11055 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYH3P11055 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYH3P11055 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MYH3P11055 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MYH3P11055 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MYH3P11055 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MYH3P11055 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MYH3P11055 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MYH3P11055 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH3P11055 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH3P11055 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH3P11055 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH3P11055 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MYH3P11055 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms