Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GLI3P10071 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GLI3P10071 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GLI3P10071 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GLI3P10071 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GLI3P10071 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GLI3P10071 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GLI3P10071 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GLI3P10071 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GLI3P10071 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GLI3P10071 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GLI3P10071 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GLI3P10071 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
GLI3P10071 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GLI3P10071 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GLI3P10071 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GLI3P10071 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GLI3P10071 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
GLI3P10071 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GLI3P10071 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GLI3P10071 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GLI3P10071 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GLI3P10071 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms