Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI2P10070 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI2P10070 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI2P10070 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
GLI2P10070 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
GLI2P10070 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
GLI2P10070 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI2P10070 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI2P10070 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI2P10070 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI2P10070 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
GLI2P10070 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
GLI2P10070 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
GLI2P10070 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI2P10070 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI2P10070 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI2P10070 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI2P10070 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
GLI2P10070 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI2P10070 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
GLI2P10070 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
GLI2P10070 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
GLI2P10070 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI2P10070 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI2P10070 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI2P10070 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI2P10070 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
GLI2P10070 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI2P10070 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI2P10070 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
GLI2P10070 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
GLI2P10070 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
GLI2P10070 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms