Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMEM225BP0DP42 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM225BP0DP42 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms