Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RD3LP0DJH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RD3LP0DJH9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms