Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNRPAP09012 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNRPAP09012 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SNRPAP09012 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms