Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IL3P08700 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL3P08700 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3P08700 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3P08700 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3P08700 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3P08700 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL3P08700 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL3P08700 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
IL3P08700 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL3P08700 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL3P08700 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL3P08700 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL3P08700 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL3P08700 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL3P08700 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL3P08700 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IL3P08700 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms