Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LDHBP07195 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LDHBP07195 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LDHBP07195 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LDHBP07195 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LDHBP07195 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LDHBP07195 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LDHBP07195 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LDHBP07195 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LDHBP07195 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LDHBP07195 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LDHBP07195 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LDHBP07195 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LDHBP07195 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LDHBP07195 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHBP07195 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHBP07195 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHBP07195 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LDHBP07195 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LDHBP07195 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms