Protein–RNA interactions for Protein: P05408

SCG5, Neuroendocrine protein 7B2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG5P05408 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG5P05408 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG5P05408 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCG5P05408 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCG5P05408 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCG5P05408 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCG5P05408 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCG5P05408 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCG5P05408 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SCG5P05408 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCG5P05408 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms