Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCCAP05165 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCCAP05165 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCCAP05165 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCCAP05165 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCCAP05165 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCCAP05165 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCCAP05165 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCCAP05165 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCCAP05165 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCCAP05165 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCCAP05165 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCCAP05165 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCCAP05165 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCCAP05165 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCCAP05165 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCCAP05165 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCCAP05165 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCCAP05165 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCCAP05165 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms