Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB1P04280 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB1P04280 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB1P04280 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRB1P04280 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRB1P04280 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRB1P04280 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRB1P04280 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRB1P04280 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRB1P04280 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRB1P04280 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRB1P04280 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms