Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FGGP02679 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FGGP02679 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FGGP02679 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FGGP02679 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
FGGP02679 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FGGP02679 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FGGP02679 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGGP02679 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGGP02679 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGGP02679 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms