Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LDLRP01130 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LDLRP01130 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRP01130 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRP01130 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRP01130 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRP01130 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LDLRP01130 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LDLRP01130 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LDLRP01130 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
LDLRP01130 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LDLRP01130 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LDLRP01130 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LDLRP01130 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms