Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
F13A1P00488 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
F13A1P00488 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F13A1P00488 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F13A1P00488 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
F13A1P00488 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F13A1P00488 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
F13A1P00488 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
F13A1P00488 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F13A1P00488 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F13A1P00488 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13A1P00488 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13A1P00488 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13A1P00488 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13A1P00488 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F13A1P00488 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms