Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK4O96013 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK4O96013 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK4O96013 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK4O96013 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK4O96013 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK4O96013 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK4O96013 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK4O96013 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK4O96013 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK4O96013 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms