Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUDT3O95989 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NUDT3O95989 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms