Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG2O94898 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG2O94898 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms