Protein–RNA interactions for Protein: O75586

MED6, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED6O75586 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED6O75586 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED6O75586 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED6O75586 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MED6O75586 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MED6O75586 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MED6O75586 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MED6O75586 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MED6O75586 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MED6O75586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MED6O75586 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MED6O75586 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MED6O75586 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms