Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PITX3O75364 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX3O75364 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PITX3O75364 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PITX3O75364 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PITX3O75364 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PITX3O75364 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITX3O75364 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITX3O75364 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITX3O75364 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITX3O75364 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms