Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCNT1O60563 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCNT1O60563 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCNT1O60563 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms