Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SUSD5O60279 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SUSD5O60279 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms