Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA2O43921 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA2O43921 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms