Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KIF1CO43896 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KIF1CO43896 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms