Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBFA2T2O43439 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBFA2T2O43439 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBFA2T2O43439 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms