Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHADO15335 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHADO15335 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHADO15335 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHADO15335 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHADO15335 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHADO15335 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHADO15335 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHADO15335 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHADO15335 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHADO15335 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHADO15335 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHADO15335 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHADO15335 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHADO15335 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHADO15335 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms