Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ANKRD28O15084 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD28O15084 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms