Protein–RNA interactions for Protein: O14745

SLC9A3R1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R1O14745 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9A3R1O14745 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9A3R1O14745 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9A3R1O14745 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms